जलप्रदूषणाचे परिणाम परत करणे फार कठीण आहे . पाणी शुद्ध करणार्‍या नैसर्गिक प्रक्रियांना वर्षे, दशके किंवा अगदी शतके लागू शकतात आणि महागड्या तांत्रिक प्रक्रियेसहही, पाण्यातून सर्व हानिकारक पदार्थ काढून टाकण्यासाठी अनेक वर्षे लागू शकतात